BioEdit(分子生物学应用软件)是一款功能非常齐全的分子生物学应用软件,bioedit可以帮助用户对核苷酸序列,蛋白质序列等进行所有的常规的分析操作,比如引物设计、序列比对、系统发育分析等,和 DNAMAN 相比,其分析内容相对更丰富一些,并且提供了很多网络程序的分析界面和接口。本文中WinWin7为大家带来的BioEdit为绿色汉化版本,感兴趣的朋友可通过ww7分享的地址来获取!
软件简介
BioEdit是一个功能齐全的免费序列对比编辑器软件。对于分子生物学来说,是一款相当不错的应用工具了。主要可以完成核苷酸序列和蛋白质序列进行所有常规的分析操作,如:序列比对、序列检索、引物设计、系统发育分析等。
BioEdit特色
1、可以完全核苷酸序列和蛋白质序列进行所有常规的分析操作
2、序列比对、序列检索、引物设计、系统发育分析等
3、和DNAMAN 相比其分析内容相对更丰富一些
BioEdit汉化说明
先行安装原英文版软件,再安装本简体中文包后运行主程序即可!
本简体中文语言包是在7.0.1基础上汉化的,同时也可以使用于各个版本的BioEdit。因采用外挂语言包形式,故软件中仍有不少地方显示为英文。
BioEdit序列拼接方法
1、在BioEdit中开启一个序列
2、而后将序列上方的一个菜单:Mode下拉式菜单改为Edit,将光标移动到序列的最末端,从粘贴板上粘贴你要增加的第二个序列就OK了。这样三个序列都前后连接到一起了。
3、这需要一个一个来,十分麻烦。Mega5软件支持将比对后的序列一下子全部放到此外一个比对后的序列后面。因此在序列连接(或拼接)中,用Mega5比BioEdit更好。要注意的是使用Mega5做连接时,要选择Edit/Build alignment,不能是Edit/view选项,不然不能编辑。
Bioedit软件使用教程开启Bioedit软件,FileOpen,开启上述比对后的fasta文件,即本例的123.fasta。模式(Mode)选择Edit,Overwrite;选择修改模式为右键插入,即I图标。对序列碱基进行编辑。删除序列使用键盘上的-键。编辑完成后,删除参考序列文件。
文件输出
点击FileSave As,保存为fasta格式,本例保存为123.fasta,覆盖旧文件。
BioEdit功能
1、手动式两端对齐四种方式:挑选和ppt,动态性爬取和拖拽,空隙插进和点一下删掉,及其在显示屏幕上的打字行为如同一个文本编辑。
2、单独Dna和碳水化合物颜色表的色调两端对齐和编写,并良好控制背景色。
3、用以从DNA序列自动生成质粒图的质粒制图插口。轻轻松松标识部位,加上箭头符号和弯折框的作用,并标识约束性酶切位点。与此同时表明polylinker的关键点,制作可运动的箭头符号和制图工具的样子。
4、动态性的根据信息的两端对齐黑影。
5、点一下颜色表编写
6、表明和打印出具备技术专业外观设计的ABI色谱。
7、将序列分构成组或族。
8、为同歩手两端对齐调节锁住分类序列的两端对齐。
9、在包括特点注释信息专用工具提醒的两端对齐对话框中应用动态性主视图对具备图型特性的序列开展注释。
10、锁住序列以避免出现意外编写。
11、在碳水化合物和多肽链序列中特定被觉得合理的标识符开展测算。
12、依照名字,LOCUS,界定,浏览,PID/NID,参照,注释或选中列中的残余頻率对序列开展排列。
13、根据参照序列合拼两端对齐。
14、增加一个两端对齐到另一个的末尾。
15、基本上的系统发育树查看器(phylip格式树),容许连接点旋转和打印出。
16、在单独序列编辑软件选用英文字母读回序列来认证手工制作键入的序列内容。
17、读写能力Genbank,Fasta,Phylip3.2,Phylip4和NBRF/PIR格式。如今还载入GCG和Clustal格式
18、运用DonGilbert的ReadSeq全自动导进和导出来此外11种格式,包含MSF,ASN.1,IG/Stanford和EMBL。
19、容许立即从剪切板导进兼容格式,而不先储存到文档。
20、轻轻松松订制编辑软件对话框的菜单栏键盘快捷键
21、RNA较为剖析,包含协变,潜在性匹配和互信息剖析(现阶段可以转化成矩阵达到10,000x10,000-但这将是一个600+Mb文档)与矩阵绘图仪的二维矩阵输出表和面积图数据信息矩阵的独立行。矩阵绘图仪和曲线图都具备点一下数据信息挑选,矩阵数据信息的矩阵绘图仪和一维曲线图现在是动态链接的
以上便是BioEdit——分子生物学应用软件!
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